深圳是全國經濟實力最強的城市之一，也是中國創新創業的重要據點。如果想要在深圳創業，注冊公司是必不可少的一步。但如果您想要同時在多個公司運營，該怎么辦呢？

首先，您需要明確一個原則：每個公司應該獨立經營，有獨立的財務賬號和納稅信息。因此，如果您想要在多個公司運營，每個公司都需要單獨注冊、辦理工商營業執照，并開設獨立的銀行賬戶。

在注冊公司時，可以選擇同一個代辦公司來辦理，以節約時間和費用。代辦公司通常會跑腿拿材料、幫忙辦理核名、網上預約、提交申請等，費用大約在500元左右，也可根據優惠活動獲得更多優惠。但需注意，代辦公司有時會收取額外費用，例如商務掛靠地址、刻章等，需要事先確認清楚。

如果您想在同一店鋪運營多個公司，可以選擇注冊一個總公司和多家分公司的模式。總公司可以擁有店面、設備和人員等資源，各分公司在總公司授權下運營，共享總公司品牌、客戶資源等。這種模式的優勢是可以減少店鋪成本、提高資源利用率，并能夠在市場營銷上形成品牌優勢。但需要注意，總公司和分公司的財務賬戶不能混淆，每家公司都需要獨立申報納稅。

在申請注冊公司時，您需要準備好一些材料。例如，公司設立登記申請書、公司章程、法人股東資格證明或自然人股東身份證及復印件、代理人身份證及復印件、住所使用證明等。這些材料對于代辦公司來說并不陌生，您只需提供相關信息即可。

最后，注冊公司雖然不是一項難事，但也需要投入時間和精力，以確保所有手續妥善辦理。在此提醒大家，總公司和分公司的業務要分開運作，各自負責，以避免在稅務等方面出現問題。同時，您還需要及時了解有關企業管理、市場營銷、財務管理等方面的信息，來更好地運營您的公司。